Учёные создали методику, которая позволяет одновременно оценить количество генов и проанализировать экспрессию белков в отдельно взятой клетке. Данная методика позволит проводить детальный анализ взаимосвязей между состоянием генов и экспрессией соответствующих белковых молекул в клетках и тканях организма. Потенциальная ценность разработанной методики, по мнению её авторов, заключается в том, что она может помочь собрать большее количество информации, необходимой для более глубокого понимания процессов развития раковых и других сложных заболеваний.

Предложенная биологами методика представляет собой сочетание традиционной флуоресцентной in situ гибридизации (FISH-метода) и PLA-метода (Proximity ligation assay) in situ.

«Насколько мне известно, это первая методика, позволяющая нам одновременно соотносить активность генов с экспрессией соответствующих белковых молекул в пределах одной клетки.

Возможность анализировать изменения состояния генов и белковой экспрессии во всей опухоли может помочь нам понять, какие процессы движут поведением опухолевых клеток» – говорит доктор Арнаб Чакраварти (Arnab Chakravarti, один из разработчиков методики, специалист в области радиационной онкологии, один из руководителей программы изучения опухолей головного мозга при центре исследования раковых заболеваний при университете штата Огайо).

В рамках проведённой работы учёные первым делом проанализировали фиксированный препарат клеток глиобластомы человека. Затем авторы исследовали ткань глиобластомы человека, обработанную парафином. И в первом и во втором случае специалисты проверяли образцы на предмет наличия/отсутствия гиперэкспрессии мутантной формы гена EGFRvIII (epidermal growth factor receptor gene), кодирующего рецепторы эпидермального фактора роста, и уровень содержания продукта данного гена в клетках глиобластомы.

«Данный метод обладает потенциалом, необходимым для детального анализа взаимосвязи между состоянием генов опухолевых клеток и экспрессией соответствующих белковых молекул в пределах клеток и тканей» – говорит Маркус Бредел (Markus Bredel, ведущий автор исследований, адъюнкт-профессор университета Алабамы в Бирмингеме).

По его словам, авторам научной работы удалось показать, что предложенная методика способна обеспечить сбор важной информации одновременно об опухолевых генах и белковых структурах на клеточном уровне организации, что особенно важно в случае исследования определённых заболеваний, например, в случае развития раковых опухолей.

«Мы считаем, что предложенная нами методика широко применима при исследовании болезней, клеток и при молекулярно-биологических исследованиях» – говорит доктор Чакраварти.

Более подробное описание проведённой научной работы можно найти в журнале Neuro-Oncology.