Группа учёных из Израиля и Канады разработали инструмент, позволяющий быстро проводить анализ молекулярного взаимодействия, имеющего место в том случае, когда вирус инфицирует клетки здорового организма. С помощью выявления взаимодействий между белками таких вирусов как ВИЧ, белками вирусов гепатита с белками, синтезируемыми клетками человеческого организма, подвергнутыми инфекции, предложенный инструмент позволит учёным разработать новые методы борьбы с вирусами, опасными для здоровья людей.

Как считает Дорон Гербер (Doron Gerber, профессор университета имени Бар-Илана в Рамат-Гане) система PING («Пинг») (Protein Interaction Network Generator) может быть использована для мгновенного определения огромного количества потенциальных взаимодействий. Важно отметить, что чувствительность нового подхода в 100–1000 раз выше, чем у используемых в настоящее время методик.

Когда вирусная инфекция проникает в клетки организма человека, то происходят серьёзные изменения в работе внутриклеточных систем, поддерживающих жизнеспособность клеток. Если говорить в общем, то данные системы становятся «заложниками» вирусного генома – они перепрограммируются на производство новых вирусных частиц. Данная особенность вирусной инфекции делает лечение пациентов, страдающих от развития вирусных инфекций в их организмах, крайне сложной задачей. Ведь в идеале лечение не должно причинять какой-либо вред клеткам организма.

Единственный безопасный способ борьбы с развитием вирусной инфекции в организме заключается в определении принципиально важных взаимодействий между вирусными белками и белками организма человека. Теоретически, данные взаимодействия могут служить мишенью для химических соединений, разрабатываемых с целью нарушения их протекания. Например, лекарственный препарат, используемый для борьбы с развитием ВИЧ-инфекции, Фузеон (Fuzeon) работает через ингибирование активности вирусных белков, направленной на прикрепление вирусов к поверхности клеток иммунной системы.

Это позволяет противостоять проникновению ВИЧ-инфекции в клетки организма хозяина. Как и многие противовирусные препараты, Фузеон используется совместно с другими лекарственными препаратами. Это связано с тем, что многие вирусы, в том числе ВИЧ, мутируют очень быстро, теряя чувствительность к определённым лекарственным препаратам. Поэтому в настоящее время существует необходимость в регулярном создании новых средств борьбы с вирусной инфекцией.

Используя «Пинг», учёные из Израиля и Канады смогли определить новые белки, которые необходимы для взаимодействия с белками вирусов гепатита С и D.

«И сейчас мы можем использовать ту же систему для поиска необходимых ингибиторов» – говорит Гербер.

По его мнению, в настоящее время существует острая необходимость разработки новых средств противостояния развитию вируса гепатита С.