Ученые разработали новый вычислительный метод, чтобы отслеживать, как конкретные мутации влияют на передачу SARS-CoV-2. Это поможет лучше понять биологию вируса и контролировать вспышки. Чтобы понять, как мутации коронавируса нового типа влияют на его передачу, ученые использовали математические модели статистической физики в эпидемиологии для создания нового метода наблюдения и анализа.

Он позволяет просматривать данные геномного наблюдения с течением времени и во многих регионах мира, а также находить влияние различных мутаций на передачу SARS-CoV-2. Исследование показало, что метод лучше всего объясняет эволюцию вируса на протяжении всей пандемии COVID-19.

«Несколько новых особенностей нашего метода заключаются в том, что он может учитывать перемещение инфицированных людей между регионами. Другие модели на это неспособны. Наш метод основан на физике и позволяет записать точное математическое выражение для эффектов передачи различных мутаций, а не полагаться на численное моделирование для оценки этих параметров», — объясняет Джон Бартон, доцент кафедры физики и астрономии Калифорнийского университета в Риверсайде.

Метод также достаточно чувствителен, чтобы выявить механизмы передачи SARS-CoV-2, которые ранее считались нейтральными.

После проверки метода ученые применили его к более чем 1,6 млн последовательностей SARS-CoV-2 из базы данных GISAID, которые были собраны в 87 географических регионах. Результаты исследования представят на мартовском собрании Американского физического общества.